导师个人信息 - 电子科大研招网

生命科学与技术学院

导师代码：	21264
导师姓名：	宁琳
性别：	男
特称：
职称：	副教授
学位：	工学博士学位
属性：	兼职
电子邮件：	ninglin3000@uestc.edu.cn

学术经历：

2019年电子科技大学生物医学工程博士毕业，研究方向为生物信息学，2019年-2021年南方医科大学博士后研究工作，现为电子科技大学生命科学与技术学院协议副教授，硕士研究生导师。

个人简介：

电子科技大学生物医学工程专业博士研究生，博士后，教授，电子科技大学硕士研究生导师，研究方向为生物信息学。科研工作方面，长期从事有关疾病和药物的计算生物学研究，重点关注相分离生物计算以及RNA和疾病、药物的大数据资源开发、数据挖掘和基于机器学习/深度学习的计算模型研究等，在Nucleic Acids Research、Briefings in Bioinformatics、International Journal of Biological Science等杂志上累计发表SCI论文三十余篇，其中以第一作者/通讯作者身份发表SCI论文14篇，多篇高被引论文，累计影响因子超过250，总引用次数超过600。主持和参与包括国家自然科学基金面上项目、中国博士后基金面上资助以及四川省自然科学基金面上项目等在内的多项国家级省部级科研项目。

科研项目：

[1] 相分离RNA计算预测研究，国家自然科学基金面上项目，62372088，2024-2027，50万，主持，在研。 [2] 相分离生物大分子计算预测研究，中国博士后科学基金面上资助，2024M750367, 2024-2025，8万，主持，在研。 [3] 抗眼底新生血管性疾病新型肽体药物的理性设计与实验验证研究，四川省自然科学基金面上项目，2023NSFSC0596，2023-2024，20万，主持，在研。 [4] 基于基因组三维结构与表观遗传信息的真核基因组复制起始机制分析与识别模型研究，国家自然科学基金委面上项目，62172078，2021-2025，61万，主要参与，在研。

研究成果：

1.Ahmed, Z., Shahzadi, K., Jin, Y., Li, R., Momanyi, B., Zulfiqar, H., Ning, L*., Lin, H*. (2024) Identification of RNA-dependent liquid-liquid phase separation proteins using an artificial intelligence strategy, Proteomics. e2400044. DOI: 10.1002/pmic.202400044. (通讯作者，IF:3.4000) 2.Zhong, B#., Dai, Y#., Chen, L., Xu, X., Lan, Y., Deng, L., Ren, L., Luo, N*., Ning, L*.(2024) ncRS: a resource of non-coding RNAs in sepsis, Comput Biol Med. 172:108256. doi: 10.1016/j.compbiomed.2024.108256. (通讯作者，TOP期刊，IF:6.9997) 3.Zhang, Y#., Liu, C#., Liu, M., Liu, T., Lin, H*., Huang, C.B*., Ning, L*. (2023) Attention is all you need: utilizing attention in AI-enabled drug discovery, Brief Bioinform., 25(1):bbad467. doi: 10.1093/bib/bbad467.(通讯作者，TOP期刊，IF:6.7996) 4.Ren, L#., Ning, L#., Yang, Y., Yang, T., Li, X., Tan, S., Ge, P., Li, S., Luo, N*., Tao, P*., Zhang, Y*. (2023) MetaboliteCOVID: A manually curated database of metabolite markers for COVID-19, Comput Biol Med., 167:107661. doi: 10.1016/j.compbiomed.2023.107661.(共同第一作者，TOP期刊，IF:6.9997) 5.Ning, L., Liu, M., Gou, Y., Yang, Y., He, B*., Huang, J*. (2022) Development and application of ribonucleic acid therapy strategies against COVID-19, Int J Biol Sci., 18(13):5070-5085. doi: 10.7150/ijbs.72706.(第一作者，TOP期刊，IF:8.1996) 6.Sun, Z#., Huang, Q#., Yang, Y., Li, S., Lv, H., Zhang, Y., Lin, H*., Ning, L*. (2022) PSnoD: identifying potential snoRNA-disease associations based on bounded nuclear norm regularization, Brief Bioinform., 23(4):bbac240. doi: 10.1093/bib/bbac240. (通讯作者，TOP期刊，IF:6.7996) 7.Zhu, H#., Fu, H#., Cui, T#., Ning, L#., Shao, H., Guo, Y., Ke, Y., Zheng, J., Lin, H., Wu, X., Liu, G., He, J., Han, X., Li, W., Zhao, X., Lu, H., Wang, D*., Hu, K*., Shen, X*. (2022) RNAPhaSep: a resource of RNAs undergoing phase separation, Nucleic Acids Res., 50(D1):D340-D346. doi: 10.1093/nar/gkab985. (共同第一作者，TOP期刊，IF:16.6009) 8.Zhou, Y., Xie, S., Yang, Y., Jiang, L., Liu, S., Li, W., Abagna, H., Ning, L*., Huang, J*. (2022) SSH2.0: A Better Tool for Predicting the Hydrophobic Interaction Risk of Monoclonal Antibody, Front Genet., 13:842127. doi: 10.3389/fgene.2022.842127. (通讯作者，IF:2.8002) 9.Ning, L., Abagna, H.B., Jiang, Q., Liu, S., Huang, J*. (2021) Development and application of therapeutic antibodies against COVID-19, Int J Biol Sci., 17(6):1486-1496. doi: 10.7150/ijbs.59149. (第一作者，TOP期刊，IF:8.1996) 10.Ning, L#., Cui, T#., Zheng, B#., Wang, N#., Luo, J#., Yang, B., Du, M., Cheng, J., Dou, Y., Wang, D*. (2021) MNDR v3.0: mammal ncRNA-disease repository with increased coverage and annotation, Nucleic Acids Res., 49(D1):D160-D164. doi: 10.1093/nar/gkaa707. (共同第一作者，TOP期刊，IF:16.6009) 11.Liu, T.Y#., Zhang, Y.C#., Lin, Y.Q#., Hu, Y.F., Zhang, Y., Wang, D*., Wang, Y*., Ning, L*. (2020) Exploration of invasive mechanisms via global ncRNA-associated virus-host crosstalk, Genomics, 112(2):1643-1650. doi: 10.1016/j.ygeno.2019.10.002. (通讯作者，IF:3.4000)

专业研究方向：